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職歴 【 表示 ／ 非表示 】

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研究分野 【 表示 ／ 非表示 】

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論文 【 表示 ／ 非表示 】

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• A <i>Bradyrhizobium</i> isolate from a marine diatom induces nitrogen-fixing nodules in a terrestrial legume

  Udita Chandola, Eric Manirakiza, Margaux Maillard, Louis Josselin Lavier Aydat, Alicia Camuel, Camille Trottier, Atsuko Tanaka, Timothee Chaumier, Eric Giraud, Leila Tirichine

  NATURE MICROBIOLOGY     2025年09月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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• When and where should aquaculture nets be deployed in a nursery site to maximize Cladosiphon okamuranus growth?

  Hikari Nagoe, Gregory N. Nishihara, Yuichiro Numata, Kandai Tozaki, Kaoru Maeganeku, Atsuko Tanaka, Yoichi Sato

  PHYCOLOGICAL RESEARCH     2025年09月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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• Carbon and nitrogen contents depends on macroalgal species, their tissue section, and development stage

  Yoichi Sato, Daisuke Saito, Eri Inomata, Atsuko Tanaka, Gregory N. Nishihara

  PHYCOLOGICAL RESEARCH     2025年07月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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• Non-cyanobacterial diazotrophs support the survival of marine microalgae in nitrogen-depleted environment

  Udita Chandola, Marinna Gaudin, Camille Trottier, Louis-Josselin Lavier-Aydat, Eric Manirakiza, Samuel Menicot, Erik Jorg Fischer, Isabelle Louvet, Thomas Lacour, Timothee Chaumier, Atsuko Tanaka, Georg Pohnert, Samuel Chaffron, Leila Tirichine

  GENOME BIOLOGY   26 ( 1 )   2025年05月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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• Comprehensive protocol for preparing diatom cell samples and associated bacterial consortia for scanning electron microscopy

  Margaux Maillard, Nicolas Stephant, Atsuko Tanaka, Leila Tirichine

  STAR PROTOCOLS   5 ( 4 )   2024年12月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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MISC（その他業績・査読無し論文等） 【 表示 ／ 非表示 】

MISC（その他業績・査読無し論文等） 【 表示 ／ 非表示 】

• 藻類学最前線 水圏の光合成を支える動的で柔らかいピレノイド

  田中 厚子

  藻類 = The Japanese journal of phycology ( 日本藻類学会 )  67 ( 1 ) 5 - 9   2019年03月  [査読有り]

   

• バイオ系のキャリアデザイン たゆたえど沈まず

  田中 厚子

  生物工学会誌 ( 日本生物工学会 )  93 ( 4 ) 225 - 227   2015年

   

科研費獲得情報 【 表示 ／ 非表示 】

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• 海藻の生育を支える海藻-微生物相互作用の全体像の解明

  基盤研究(B)

  課題番号: 20H03118

  研究期間: 2020年04月  -  2023年03月 

  代表者: 伊藤 通浩, 小西 照子, 田中 厚子, 岩崎 公典 

  直接経費: 13,800,000（円）  間接経費: 17,940,000（円）  金額合計: 4,140,000（円）

  　概要を見る

  オキナワモズク微生物叢の網羅的解析法の構築を試みた。16S rRNA遺伝子のアンプリコンシーケンシングによる微生物叢解析法をオキナワモズクに適用するにあたり、実際の微生物叢に近いと考えられるショットガンシーケンシングによるオキナワモズク微生物叢データと、高い相関を示すデータを得られるPCR条件を72通りの組み合わせから選抜した。次に、本研究で選抜したPCR条件を用いて、沖縄県内8地点から採取したオキナワモズクとオキナワモズク漁場の微生物叢を解析した。結果として、オキナワモズクとその周辺海水の微生物叢は明確に異なっており、オキナワモズクにはオキナワモズクの微生物叢が形成されていること、および、オキナワモズク微生物叢は産地ごとの特徴があることが判明した。また、沖縄県本部町備瀬の地先のオキナワモズク漁場にモズク微生物叢を時系列で追跡する野外実験を行い、モズクの採取時期によりオキナワモズク微生物叢に大きな差異が見出された。以上のオキナワモズク微生物叢データより、オキナワモズクの全サンプルに見出される１菌種を見出すことができた。 オキナワモズクのトランスクリプトーム解析を行う目的で市販の植物用キットを用いてRNA抽出を行ったところ、収量がきわめて低く、市販キットの標準プロトコルはオキナワモズクに適用できないことが判明した。そこで、独自のステップを追加するなど当該プロトコルを修正し、遺伝子発現解析に適用可能なオキナワモズクからのRNA抽出法を確立した。 オキナワモズクの藻体成分の解析の結果、オキナワモズク細胞壁多糖組成に生長段階ごとの差異が見出された。水溶成分を標的としたメタボローム解析では、脂肪酸が多く検出された一方、有機酸やビタミン類の検出には解析法の修正が必要であることが明らかとなった。

• Mitigating climate change through seaweed aquaculture

  基盤研究(B)

  課題番号: 20H03076

  研究期間: 2020年04月  -  2023年03月 

  代表者: ニシハラ グレゴリーナオキ, 遠藤 光, 田中 厚子, 寺田 竜太, 佐藤 陽一 

  直接経費: 13,700,000（円）  間接経費: 17,810,000（円）  金額合計: 4,110,000（円）

• 海藻の生育を支える海藻-微生物相互作用の全体像の解明

  基盤研究(B)

  課題番号: 20H03118

  研究期間: 2020年04月  -  2023年03月 

  代表者: 伊藤 通浩, 小西 照子, 田中 厚子, 岩崎 公典 

  直接経費: 13,800,000（円）  間接経費: 17,940,000（円）  金額合計: 4,140,000（円）

  　概要を見る

  オキナワモズク微生物叢の網羅的解析法の構築を試みた。16S rRNA遺伝子のアンプリコンシーケンシングによる微生物叢解析法をオキナワモズクに適用するにあたり、実際の微生物叢に近いと考えられるショットガンシーケンシングによるオキナワモズク微生物叢データと、高い相関を示すデータを得られるPCR条件を72通りの組み合わせから選抜した。次に、本研究で選抜したPCR条件を用いて、沖縄県内8地点から採取したオキナワモズクとオキナワモズク漁場の微生物叢を解析した。結果として、オキナワモズクとその周辺海水の微生物叢は明確に異なっており、オキナワモズクにはオキナワモズクの微生物叢が形成されていること、および、オキナワモズク微生物叢は産地ごとの特徴があることが判明した。また、沖縄県本部町備瀬の地先のオキナワモズク漁場にモズク微生物叢を時系列で追跡する野外実験を行い、モズクの採取時期によりオキナワモズク微生物叢に大きな差異が見出された。以上のオキナワモズク微生物叢データより、オキナワモズクの全サンプルに見出される１菌種を見出すことができた。 オキナワモズクのトランスクリプトーム解析を行う目的で市販の植物用キットを用いてRNA抽出を行ったところ、収量がきわめて低く、市販キットの標準プロトコルはオキナワモズクに適用できないことが判明した。そこで、独自のステップを追加するなど当該プロトコルを修正し、遺伝子発現解析に適用可能なオキナワモズクからのRNA抽出法を確立した。 オキナワモズクの藻体成分の解析の結果、オキナワモズク細胞壁多糖組成に生長段階ごとの差異が見出された。水溶成分を標的としたメタボローム解析では、脂肪酸が多く検出された一方、有機酸やビタミン類の検出には解析法の修正が必要であることが明らかとなった。

• Mitigating climate change through seaweed aquaculture

  基盤研究(B)

  課題番号: 20H03076

  研究期間: 2020年04月  -  2023年03月 

  代表者: ニシハラ グレゴリーナオキ, 遠藤 光, 田中 厚子, 寺田 竜太, 佐藤 陽一 

  直接経費: 13,700,000（円）  間接経費: 17,810,000（円）  金額合計: 4,110,000（円）

• 海藻の生育を支える海藻-微生物相互作用の全体像の解明

  基盤研究(B)

  課題番号: 20H03118

  研究期間: 2020年04月  -  2023年03月 

  代表者: 伊藤 通浩, 小西 照子, 田中 厚子, 岩崎 公典 

  直接経費: 13,800,000（円）  間接経費: 17,940,000（円）  金額合計: 4,140,000（円）

  　概要を見る

  オキナワモズク微生物叢の網羅的解析法の構築を試みた。16S rRNA遺伝子のアンプリコンシーケンシングによる微生物叢解析法をオキナワモズクに適用するにあたり、実際の微生物叢に近いと考えられるショットガンシーケンシングによるオキナワモズク微生物叢データと、高い相関を示すデータを得られるPCR条件を72通りの組み合わせから選抜した。次に、本研究で選抜したPCR条件を用いて、沖縄県内8地点から採取したオキナワモズクとオキナワモズク漁場の微生物叢を解析した。結果として、オキナワモズクとその周辺海水の微生物叢は明確に異なっており、オキナワモズクにはオキナワモズクの微生物叢が形成されていること、および、オキナワモズク微生物叢は産地ごとの特徴があることが判明した。また、沖縄県本部町備瀬の地先のオキナワモズク漁場にモズク微生物叢を時系列で追跡する野外実験を行い、モズクの採取時期によりオキナワモズク微生物叢に大きな差異が見出された。以上のオキナワモズク微生物叢データより、オキナワモズクの全サンプルに見出される１菌種を見出すことができた。 オキナワモズクのトランスクリプトーム解析を行う目的で市販の植物用キットを用いてRNA抽出を行ったところ、収量がきわめて低く、市販キットの標準プロトコルはオキナワモズクに適用できないことが判明した。そこで、独自のステップを追加するなど当該プロトコルを修正し、遺伝子発現解析に適用可能なオキナワモズクからのRNA抽出法を確立した。 オキナワモズクの藻体成分の解析の結果、オキナワモズク細胞壁多糖組成に生長段階ごとの差異が見出された。水溶成分を標的としたメタボローム解析では、脂肪酸が多く検出された一方、有機酸やビタミン類の検出には解析法の修正が必要であることが明らかとなった。

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