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• Vegetation variety affected by local environments in a coral reef lagoon

  Kandai Tozaki, Gregory N. Nishihara, Azusa Kawate, Teruko Konishi, Yoichi Sato, Michihiro Ito, Hiroyuki Fujimura, Atsuko Tanaka

  Phycological Research ( Wiley )    2024年01月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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  Abstract From shore to sea, coral reefs can generally be divided into a lagoon zone, a reef crest, and a fore reef. Environmental variables, such as nutrient fluxes, light availability, and water temperature, vary among the zones and influence the biodiversity of submerged macrophytes. Additionally, the biodiversity of vegetation within the lagoon appears to be affected by multiple and extremely localized conditions. We investigated the impact of small‐scale variations on vegetation diversity, and implemented an ecological survey within a well‐defined area inside of a lagoon at Bise Point, Okinawa, Japan. A total of 20 macroalgal species (four green algae, six brown algae, and ten red algae) and four seagrass species were identified from the surveyed quadrats over a period of 19 months, from October 2019 to March 2021. Patterns in species occurrence were spatially and temporally heterogeneous. Notably, water motion and sediment flux were highly variable among the monitoring sites. Redundancy analysis allowed us to evaluate the significance of environmental factors on the vegetation of each monitoring area. Six environmental factors were considered in this study, but their impacts on local vegetation were not equivalent. Redundancy analysis suggested that water depth, flow velocity, and the ratio of the small fraction of deposition particles were the three factors with the strongest influence on local vegetation. This study provides some crucial insights into the determinants of vegetation in a coral reef lagoon. Our findings suggest that the factors we examined exert more influence on the vegetation than seasonal effects.

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• Characterization of cell wall polysaccharide from <scp><i>Cladosiphon okamuranus</i></scp> cultivated in different locations

  Mahanama Geegana Gamage Awanthi, Natsuki Nakasone, Hirosuke Oku, Kanefumi Kitahara, Michihiro Ito, Atsuko Tanaka, Yoichi Sato, Yuichiro Numata, Teruko Konishi

  Phycological Research ( Wiley )    2023年08月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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  SUMMARY Cladosiphon okamuranus is an excellent source of fucoidan among any brown algae spp. However, the structure of polysaccharide varies significantly depending on the species, harvesting season and geographical location. To understand how geographic location affects the structure of cell wall polysaccharide, C. okamuranus cultivated in eight places (Bise, Katsuren, Yonashiro, Shikiya, Karimata, Nishihara, Hisamatsu and Ishigaki) in Ryukyu archipelago were collected during the peak harvesting time and the cell wall polysaccharide was analyzed physiochemically. The cell wall was sequentially fractionated into five fractions and its 80% was consisted of hot water fraction (HW) (60–70%) and hemicellulose‐I fraction (HC‐I) (15–20%), which mainly contained fucoidan composed of fucose (Fuc), glucuronic acid (GlcA) and sulfate (SO₃⁻). Although the chemical composition and molecular weight of fucoidan in HW was slightly different at different places, the composition of Fuc, GlcA and SO₃⁻ was constant in the molar ratio of 1.0:0.5:0.7–1.0 respectively, suggesting that relatively similar structural fucoidan from C. okamuranus can be obtained from any geographical location in Okinawa Prefecture during peak time. However, considerable variation in the sugar composition in HC‐I was observed, despite the uniform molecular weight and SO₃⁻. Particularly, HC‐I from Bise, where is the northern part of Okinawa Island, is composed of significantly higher amounts of Glc, Gal, Man, Xyl and morphologically thicker lateral branches compared to algae from the other parts of the island.

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• Localization and characterization θ carbonic anhydrases in Thalassiosira pseudonana

  Hermanus Nawaly, Atsuko Tanaka, Yui Toyoshima, Yoshinori Tsuji, Yusuke Matsuda

  Photosynthesis Research ( Springer Science and Business Media LLC )    2023年03月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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• Pleiotropic Functions of Nitric Oxide Produced by Ascorbate for the Prevention and Mitigation of COVID-19: A Revaluation of Pauling’s Vitamin C Therapy

  Hideo Yamasaki, Hideyuki Imai, Atsuko Tanaka, Joji M. Otaki

  Microorganisms ( MDPI AG )  11 ( 2 ) 397 - 397   2023年02月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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  Linus Pauling, who was awarded the Nobel Prize in Chemistry, suggested that a high dose of vitamin C (l-ascorbic acid) might work as a prevention or treatment for the common cold. Vitamin C therapy was tested in clinical trials, but clear evidence was not found at that time. Although Pauling’s proposal has been strongly criticized for a long time, vitamin C therapy has continued to be tested as a treatment for a variety of diseases, including coronavirus infectious disease 2019 (COVID-19). The pathogen of COVID-19, SARS-CoV-2, belongs to the β-coronavirus lineage, which includes human coronavirus, severe acute respiratory syndrome (SARS), and Middle East respiratory syndrome (MERS). This review intends to shed new light on vitamin C antiviral activity that may prevent SARS-CoV-2 infection through the chemical production of nitric oxide (NO). NO is a gaseous free radical that is largely produced by the enzyme NO synthase (NOS) in cells. NO produced by upper epidermal cells contributes to the inactivation of viruses and bacteria contained in air or aerosols. In addition to enzymatic production, NO can be generated by the chemical reduction of inorganic nitrite (NO2−), an alternative mechanism for NO production in living organisms. Dietary vitamin C, largely contained in fruits and vegetables, can reduce the nitrite in saliva to produce NO in the oral cavity when chewing foods. In the stomach, salivary nitrite can also be reduced to NO by vitamin C secreted from the epidermal cells of the stomach. The strong acidic pH of gastric juice facilitates the chemical reduction of salivary nitrite to produce NO. Vitamin C contributes in multiple ways to the host innate immune system as a first-line defense mechanism against pathogens. Highlighting chemical NO production by vitamin C, we suggest that controversies on the therapeutic effects of vitamin C in previous clinical trials may partly be due to less appreciation of the pleiotropic functions of vitamin C as a universal bioreductant.

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• Fractionation and characterization of cell wall polysaccharides from the brown alga Cladosiphon okamuranus

  Mahanama Geegana Gamage Awanthi, Manatsu Umosa, Yoshiaki Yuguchi, Hirosuke Oku, Kanefumi Kitahara, Michihiro Ito, Atsuko Tanaka, Teruko Konishi

  Carbohydrate Research ( Elsevier BV )  523   108722 - 108722   2023年01月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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MISC（その他業績・査読無し論文等） 【 表示 ／ 非表示 】

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• 藻類学最前線 水圏の光合成を支える動的で柔らかいピレノイド

  田中 厚子

  藻類 = The Japanese journal of phycology ( 日本藻類学会 )  67 ( 1 ) 5 - 9   2019年03月  [査読有り]

   

• バイオ系のキャリアデザイン たゆたえど沈まず

  田中 厚子

  生物工学会誌 ( 日本生物工学会 )  93 ( 4 ) 225 - 227   2015年

   

科研費獲得情報 【 表示 ／ 非表示 】

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• 海藻の生育を支える海藻-微生物相互作用の全体像の解明

  基盤研究(B)

  課題番号: 20H03118

  研究期間: 2020年04月  -  2023年03月 

  代表者: 伊藤 通浩, 小西 照子, 田中 厚子, 岩崎 公典 

  直接経費: 13,800,000（円）  間接経費: 17,940,000（円）  金額合計: 4,140,000（円）

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  オキナワモズク微生物叢の網羅的解析法の構築を試みた。16S rRNA遺伝子のアンプリコンシーケンシングによる微生物叢解析法をオキナワモズクに適用するにあたり、実際の微生物叢に近いと考えられるショットガンシーケンシングによるオキナワモズク微生物叢データと、高い相関を示すデータを得られるPCR条件を72通りの組み合わせから選抜した。次に、本研究で選抜したPCR条件を用いて、沖縄県内8地点から採取したオキナワモズクとオキナワモズク漁場の微生物叢を解析した。結果として、オキナワモズクとその周辺海水の微生物叢は明確に異なっており、オキナワモズクにはオキナワモズクの微生物叢が形成されていること、および、オキナワモズク微生物叢は産地ごとの特徴があることが判明した。また、沖縄県本部町備瀬の地先のオキナワモズク漁場にモズク微生物叢を時系列で追跡する野外実験を行い、モズクの採取時期によりオキナワモズク微生物叢に大きな差異が見出された。以上のオキナワモズク微生物叢データより、オキナワモズクの全サンプルに見出される１菌種を見出すことができた。 オキナワモズクのトランスクリプトーム解析を行う目的で市販の植物用キットを用いてRNA抽出を行ったところ、収量がきわめて低く、市販キットの標準プロトコルはオキナワモズクに適用できないことが判明した。そこで、独自のステップを追加するなど当該プロトコルを修正し、遺伝子発現解析に適用可能なオキナワモズクからのRNA抽出法を確立した。 オキナワモズクの藻体成分の解析の結果、オキナワモズク細胞壁多糖組成に生長段階ごとの差異が見出された。水溶成分を標的としたメタボローム解析では、脂肪酸が多く検出された一方、有機酸やビタミン類の検出には解析法の修正が必要であることが明らかとなった。

• Mitigating climate change through seaweed aquaculture

  基盤研究(B)

  課題番号: 20H03076

  研究期間: 2020年04月  -  2023年03月 

  代表者: ニシハラ グレゴリーナオキ, 遠藤 光, 田中 厚子, 寺田 竜太, 佐藤 陽一 

  直接経費: 13,700,000（円）  間接経費: 17,810,000（円）  金額合計: 4,110,000（円）

• 珪藻ピレノイドの機能から読み解く，海洋二次葉緑体のグローバルインパクト

  ■■■

  課題番号: 00000000

  研究期間: 2019年04月  -  2024年03月 

  代表者: 松田 祐介 

  直接経費: 0（円）  間接経費: 0（円）  金額合計: 0（円）

• 褐藻切断組織の組織癒合過程におけるオーキシン調節作用の解明

  基盤研究(C)

  課題番号: 17K07473

  研究期間: 2017年04月  -  2020年03月 

  代表者: 田中　厚子  研究分担者: 松浦 英幸 北海道大学, 農学研究院, 教授 (20344492)

  直接経費: 3,900,000（円）  間接経費: 1,170,000（円）  金額合計: 5,070,000（円）

• 褐藻切断組織の組織癒合過程におけるオーキシン調節作用の解明

  基盤研究(C)

  課題番号: 00000000

  研究期間: 2017年04月  -  2020年03月 

  代表者: 田中 厚子, 松浦 英幸, 農学研究院 

  直接経費: 3,900,000（円）  間接経費: 5,070,000（円）  金額合計: 1,170,000（円）

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