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論文 【 表示 ／ 非表示 】

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• Virus-Specific Impact of Respiratory Viruses on Adult Emergency Department Outcomes

  Nabeya D, Kinjo T, Nishiyama N, Kami W, Arakaki W, Okamoto T, Kuniyoshi K, Nishiyama M, Nakamura H, Haranaga S, Fujita J, Yamamoto K, Shiiki S, Kishaba T.

  Journal of Medical Virology   98 ( 7 ) e71039   2026年06月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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• Cloverleaf-like Nuclei and Cytoplasmic Tails in Hypersensitivity Pneumonitis.

  Arakaki W, Kinjo T, Ikemiyagi N, Yamamoto K

  Internal medicine (Tokyo, Japan) ( 一般社団法人 日本内科学会 )  65 ( 1 ) 193 - 193   2026年01月

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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    PubMed CiNii Research

• Bacterial pneumonia co-infection in adult inpatients with coronavirus disease 2019 during the Omicron variants epidemic in Okinawa, Japan: risk factors and clinical outcomes.

  Kami W, Ideguchi S, Miyagi K, Tasato D, Higa F, Nakamura H, Kinjo T, Nakamatsu M, Haranaga S, Tokushige A, Fujita J, Yamamoto K

  Respiratory investigation ( Respiratory Investigation )  63 ( 6 ) 1087 - 1092   2025年11月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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  BACKGROUND: The clinical characteristics and risk factors for bacterial pneumonia co-infection in patients with coronavirus disease 2019 (COVID-19) since the epidemic of Omicron variants remain unclear. METHODS: This retrospective study included adult inpatients with COVID-19 at four tertiary hospitals in Okinawa, Japan, between May and July 2023. Bacterial pneumonia co-infection was diagnosed on the basis of new infiltrates on chest radiography, the presence of neutrophils on sputum Gram stain with a positive culture, and the requirement for antimicrobial therapy. We evaluated patient characteristics, detected microbes, assessed patient outcomes, and analyzed the risk factors for bacterial pneumonia co-infection. RESULTS: Among 458 patients initially considered, 358 were eligible (median age 77 years; 55 % male, and 19 % unvaccinated against severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Bacterial pneumonia was identified in 60 patients (17 %). The most common pathogens were Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, and Haemophilus influenzae, with oral flora detected in 40 % of cases. Mortality was significantly higher in patients with bacterial pneumonia than in those without. Multivariate analysis identified age, male sex, cerebrovascular disease, delayed antiviral therapy, and lower oxygen saturation to fraction of inspired oxygen ratio as independent risk factors for bacterial pneumonia co-infection. CONCLUSIONS: Co-infection with bacterial pneumonia significantly affected the outcomes of patients with COVID-19 during the XBB Omicron variant epidemic. Early antiviral therapy and targeted prevention strategies, particularly for patients with cerebrovascular disease, can help reduce the risk of bacterial pneumonia-associated complications.

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    PubMed

• Evaluation of mlstverse system for accurate subspecies identification and drug resistance prediction in Mycobacterium abscessus species.

  Arakaki W, Kinjo T, Kami W, Hashioka H, Nabeya D, Nagano H, Yoshida S, Tsuyuguchi K, Matsumoto Y, Nakamura S, Fujita J, Yamamoto K

  Microbiology spectrum ( Microbiology Spectrum )  13 ( 9 ) e0064325   2025年09月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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  UNLABELLED: Accurate subspecies identification and drug susceptibility testing (DST) are essential for appropriate clinical management, particularly in patients infected with Mycobacterium abscessus species (MABS). We developed a novel software, mlstverse, which uses multi-locus sequence typing to identify non-tuberculous mycobacteria (NTM) species, demonstrating rapid and accurate diagnostic performance. However, these studies included only a limited number of MABS samples. In this study, we focused on MABS and evaluated the diagnostic accuracy of the system for subspecies identification and drug resistance prediction for clarithromycin (CAM) and amikacin (AMK). A total of 56 clinical isolates, previously identified as MABS by conventional methods, were analyzed. The mlstverse identified two isolates as M. intracellulare and 54 isolates as MABS, with 28 identified as M. abscessus subsp. abscessus (MAB) and 26 as M. abscessus subsp. massiliense (MMA). All results obtained through mlstverse were fully consistent with the species/subspecies exhibiting the highest average nucleotide identity (ANI) values. In contrast to the identification by ANI values, the mlstverse system clearly distinguished between MABS subspecies, with the mean differences between the highest and second-highest MLST scores of 0.16 for MAB and 0.33 for MMA, respectively. The system predicted drug susceptibility to CAM and AMK with high concordance to phenotypic DST (CAM: 98.1%, AMK: 100%). These results suggest that mlstverse provides a reliable method for accurate subspecies identification and drug resistance prediction in MABS, supporting the potential of integrating portable next-generation sequencing technologies with real-time software analysis for improved diagnostic accuracy and treatment strategies in patients with NTM infections. IMPORTANCE: Accurate subspecies identification and drug susceptibility testing (DST) are essential for appropriate clinical management of Mycobacterium abscessus species (MABS) infections. We previously developed mlstverse, a novel software utilizing multi-locus sequence typing to identify non-tuberculous mycobacteria (NTM species, demonstrating rapid and accurate diagnostic performance. However, these studies included only a limited number of MABS samples. In this study, we focused on MABS and evaluated the diagnostic accuracy of the system for subspecies identification and drug resistance prediction for clarithromycin (CAM) and amikacin (AMK). We showed that mlstverse can clearly distinguish MAB subspecies compared to ANI values and predicted drug susceptibility to CAM and AMK with high concordance to phenotypic DST. The mlstverse system provides a reliable method for accurate subspecies identification and drug resistance prediction in MABS, supporting the potential of integrating portable next-generation sequencing technologies with real-time software analysis for improved diagnostic accuracy and treatment strategies in patients with NTM infections.

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• A retrospective observational study of the nosocomial outbreak caused by human rhinovirus A34.

  Fujita M, Kinjo T, Kami W, Arakaki W, Nabeya D, Kohama M, Tohyama J, Oki H, Motooka D, Nakamura S, Yamamoto K, Fujita J

  Journal of infection and chemotherapy : official journal of the Japan Society of Chemotherapy ( Journal of Infection and Chemotherapy )  31 ( 9 ) 102778 - 102778   2025年09月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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  BACKGROUND: Past reports of nosocomial outbreak due to human rhinovirus (HRV) in adults are limited. We report a case of nosocomial outbreak of HRV-A34 in a long-term care facility with a literature review. METHODS: Multiplex real-time polymerase chain reaction assay (Allplex™ RV Essential Assay) was used for the detection of HRV. After whole genome sequencing (WGS), genomic data of HRV-A strains obtained from the GenBank database were used for phylogenetic comparison with outbreak strains. RESULTS: A nosocomial outbreak of HRV occurred between August 22 and September 4, 2021. During the outbreak, 17 patients had respiratory symptoms and 14 patients were positive for HRV. Additionally, HRV was detected in nine asymptomatic patients. The attack rate reached 58 %. HRV was identified five days after the onset of index case and the outbreak was terminated in 13 days. There were no significant differences on their median age (37 vs 44 years old, p = 0.1221) and sex (male gender 61 % vs 39 %, p = 1.000) between symptomatic and asymptomatic HRV patients. No patients developed pneumonia and died. WGS showed that outbreak strains were genetically identical and belonged to the HRV-A34. Literature review showed past outbreaks were caused by either HRV-A or HRV-C, and the mortality rate was reported to be 22 % at highest. The present report is the first case of nosocomial outbreak of HRV-A34. CONCLUSION: Although nosocomial HRV infection is difficult to suppress, even with strengthened infection control measures, prompt identification of HRV is important. HRV should not be underestimated, especially in long-term care facilities.

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著書 【 表示 ／ 非表示 】

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• 呼吸器ウイルス感染症

  金城　武士 ( 担当: 単著 )

  医学書院  2022年11月 ( 担当ページ: p.462-468 )

• 高齢者診療のための臨床検査ガイド

  金城武士 ( 担当: 共著 , 担当範囲: 上気道炎・感冒 )

  診断と治療社  2022年05月 ( ページ数: 364 ,  担当ページ: p.42-43 )

• 呼吸器感染症（第３版）Ⅳ－その他の呼吸器疾患を含めて－

  金城武士, 平田哲生, 藤田次郎 ( 担当: 共著 , 担当範囲: 糞線虫症 )

  日本臨牀社  2021年11月 ( ページ数: 388 ,  担当ページ: p.240-244 )

• 呼吸器感染症（第３版）Ⅳ－その他の呼吸器疾患を含めて－

  金城武士, 平田哲生, 藤田次郎 ( 担当: 共著 , 担当範囲: 糞線虫症 )

  日本臨牀社  2021年11月 ( ページ数: 388 ,  担当ページ: p.240-244 )

• 臨床検査を使いこなす

  金城武士 ( 担当: 共著 , 担当範囲: ヒトメタニューモウイルス（hMPV） )

  日本医師会  2021年06月 ( ページ数: 349 ,  担当ページ: p.283-284 )

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MISC（その他業績・査読無し論文等） 【 表示 ／ 非表示 】

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• 非結核性抗酸菌症

  金城　武士

  日本医事新報 ( 日本医事新報社 )  ( 5212 ) 9   2024年03月  [査読有り]

   

• 非結核性抗酸菌症に対する新規治療法の開発状況

  金城　武士

  臨床と微生物 ( 近代出版 )  51 ( 1 ) 59 - 63   2024年01月

   

• 第５章：検査

  金城武士

  レジオネラ感染症総まとめ ( 日本医事新報社 )    46 - 56   2024年01月

   

• 呼吸器ウイルス感染症

  金城武士

  呼吸器ジャーナル   70 ( 4 ) 462 - 468   2022年11月

   

• 上気道感染症

  金城武士, 藤田次郎

  薬局   73 ( 4 ) 782 - 785   2022年03月

   

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研究発表等の成果普及活動 【 表示 ／ 非表示 】

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• 3. ペメトレキセド維持療法長期継続にて画像上完全奏効が得られた進行肺腺癌の1例(第38回日本呼吸器内視鏡学会九州支部会)

  喜友名 朋, 上 若生, 古堅 誠, 西山 直哉, 柴原 大典, 金城 武士, 宮城 一也, 原永 修作, 比嘉 太, 健山 正男, 藤田 次郎

  気管支学  2015年  -  2015年   

  CiNii Research

学術関係受賞 【 表示 ／ 非表示 】

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• 琉球大学医学部医学科同窓会若手研究者　学術奨励賞

  2020年06月18日   琉球大学医学部医学科同窓会  

  受賞者: 金城武士

• 琉球大学大学院医学研究科　研究・教育業績優秀賞

  2019年01月   琉球大学大学院医学研究科  

  受賞者: 金城武士

• 沖縄県医科学研究財団　研究奨励賞

  2018年12月05日   沖縄県医科学研究財団  

  受賞者: 金城武士

• 琉球大学大学院医学研究科　研究・教育業績優秀賞

  2018年01月   琉球大学大学院医学研究科  

  受賞者: 金城武士

• 琉球大学大学院医学研究科　研究・教育業績優秀賞

  2017年01月   琉球大学大学院医学研究科  

  受賞者: 金城武士

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科研費獲得情報 【 表示 ／ 非表示 】

科研費獲得情報 【 表示 ／ 非表示 】

• SARS-CoV-2感染者に誘導された抗体の感染防御能と交叉免疫性解析

  ■■■

  課題番号: 00000000

  研究期間: 2021年04月  -  2023年03月 

  代表者: 木戸 博、金城 武士(受託研究) 

  直接経費: 1,221,000（円）  間接経費: 1,221,000（円）  金額合計: 0（円）

• COVID-19ウィルスゲノムシーケンシングによるワクチン・薬剤耐性関連変異株・海外変異株の予防的国内監視システムの構築

  ■■■

  課題番号: 00000000

  研究期間: 2021年04月  -  2022年03月 

  代表者: 小崎 健次郎、金城 武士、その他 

  直接経費: 1,000,000（円）  間接経費: 1,300,000（円）  金額合計: 300,000（円）

• インドネシアに流行する抗酸菌のゲノム疫学研究

  国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))

  課題番号: 20KK0179

  研究期間: 2020年10月  -  2023年03月 

  代表者: 中村 昇太, 松本 悠希, 金城 武士 

  直接経費: 14,300,000（円）  間接経費: 18,590,000（円）  金額合計: 4,290,000（円）

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  2020年度はリアルタイム同定システムの構築を行った。これまでに我々が開発してきたMLSTをベースとした解析手法を用いることで、ゲノムサイズの10倍程度という少量のデータがあれば、NTMの菌種同定を亜種レベルで行うことができることが、これまでの検討により判明していた。そこでシークエンス中にリアルタイムに配列が得られる次世代シークエンサーであるMinIONを用いてこの手法を拡張することで、シークエンスを行いながら解読されたゲノム配列を用いて菌種同定を行うリアルタイム解析システムを開発した。開発した解析システムを大阪大学内のオンプレミスの計算ノード群上に構築し、計算ネットワーク基盤を構築した。この解析システムではMinIONシークエンサーに直接接続されデータの取得を担う末端計算ノードと、配列解析を行う計算ノードが分離しても動作するように設計されており、病院検査室等でシークエンスされたデータがインターネットを介してリアルタイムに解析が行われる。これにより、MinIONシークエンサーに接続された計算機が大阪大学内のオンプレミスへシークエンスデータを送信・解析が行われるため、病院検査室の検査担当者は情報科学の専門知識なしに高精度な菌種同定結果を得ることが可能となった。 2021年度以降は、海外共同研究者である Karuniawati 副医学部長の協力のもと、この解析システムをインドネシア大学およびその連携病院へ導入し、インドネシアにおける結核の疫学調査の実施を進める。

その他研究費獲得情報 【 表示 ／ 非表示 】

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• 非結核性抗酸菌症の迅速・高精度同定法の臨床応用

  研究費種類: 公的研究費（省庁・独法・大学等）  参画方法: 研究代表者

  研究種別: 研究助成  事業名: 大阪大学微生物病研究所共同研究

  研究期間: 2022年04月  -  2025年03月 

  連携研究者: 中村昇太  資金配分機関: 大阪大学

  直接経費: 4,500,000（円）  間接経費: 0（円）  金額合計: 4,500,000（円）

• 病院外療養患者に対応可能なハイブリッド型バーチャル試験の手法を取り入れたCOVID-19患者におけるコルヒチン第3相試験プロトコルコンセプト作成

  研究費種類: 公的研究費（省庁・独法・大学等）  参画方法: 研究代表者

  研究種別: 研究助成  事業名: 臨床研究・治験推進研究事業

  研究期間: 2021年10月  -  2023年03月 

  資金配分機関: 国立研究開発法人日本医療研究開発機構

  直接経費: 5,000,000（円）  間接経費: 1,500,000（円）  金額合計: 6,500,000（円）

• SARS-CoV-2感染者に誘導された抗体の感染防御能と交叉免疫性解析

  研究費種類: 公的研究費（省庁・独法・大学等）  参画方法: 研究協力者

  研究種別: 受託研究  事業名: 先進的医療機器・システム等技術開発事業

  研究期間: 2021年04月  -  2023年03月 

  代表者: 木戸博  資金配分機関: 国立研究開発法人日本医療研究開発機構

  直接経費: 1,221,000（円）  間接経費: 0（円）  金額合計: 1,221,000（円）

• COVID-19ウィルスゲノムシーケンシングによるワクチン・薬剤耐性関連変異株・海外変異株の予防的国内監視システムの構築

  研究費種類: 公的研究費（省庁・独法・大学等）  参画方法: 研究分担者

  研究種別: 研究助成  事業名: 新興・再興感染症に対する革新的医薬品等開発推進研究事業

  研究期間: 2021年04月  -  2022年03月 

  代表者: 小崎健次郎  資金配分機関: 国立研究開発法人日本医療研究開発機構

  直接経費: 1,000,000（円）  間接経費: 300,000（円）  金額合計: 1,300,000（円）

• 新型コロナウイルス感染症（COVID-19）患者における低用量コルヒチンによる宿主過剰炎症反応予防に向けた抗炎症治療の医師主導治験による開発

  研究費種類: 公的研究費（省庁・独法・大学等）  参画方法: 研究代表者

  研究種別: 研究助成  事業名: 新興・再興感染症に対する革新的医薬品等開発推進研究事業

  研究期間: 2020年10月  -  2022年03月 

  資金配分機関: 国立研究開発法人日本医療研究開発機構

  直接経費: 50,000,000（円）  間接経費: 15,000,000（円）  金額合計: 65,000,000（円）

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