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• ハゼ亜目魚類の進化・多様性

学位論文 【 表示 ／ 非表示 】

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• Diversity and evolution of life histories of gobioid fishes from the viewpoint of heterochrony: Contribution to ichthyofauna of the Ryukyu Islands

  2002年03月 

論文 【 表示 ／ 非表示 】

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• A new perspective on the evolution of "Kawara" roof tiles in Ryukyu: A multidisciplinary non-destructive analysis of roof tile transition at Shuri Castle, Ryukyu Islands, Japan

  Aoyama Hiroaki, Yamagiwa Kaishi, Taira Wataru, Kon Takeshi

  PLOS ONE ( PLoS ONE )  17 ( 11 ) e0277560 - e0277560   2022年11月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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  A unique historical architecture was created at Shuri Castle (Shuri-jo) in the Ryukyu Islands by its “Kawara” roof tiles. After the 13th and 14th centuries, Kawara tiles were introduced to the Ryukyu Islands from several regions, including China, Korea, and mainland Japan, and evolved shapes and patterns that are unique to this island region. However, the transition of some internal features, such as the chemical components and microstructure, had not been analyzed. This study used a multi-faceted approach for such internal data and non-destructive quantitative methods to propose a new perspective on the evolution of historical Ryukyuan Kawara. We analyzed two styles of Ryukyuan Kawara from the 13th to 15th centuries and found that the material processing and firing conditions of the two styles were very similar, even though it had been suggested that they had different origins. A quantitative analysis of tiles from the 16th to 19th centuries revealed a transition in color tone to red, leading to the modern traditional Ryukyuan tiles; traces of changes in firing conditions were also found along with this transition. Finally, the study revealed that the evolution of Ryukyuan Kawara consisted of changed factors, e.g. surface color, and unchanged factors, e.g. paste density. Previous archaeological studies mainly focused on changing external characteristics, such as form and pattern; however, our analysis showed that the internal features changed, while the elemental composition and paste density remained constant from the appearance of the roof tiles until the 19th century. We propose that this is related to different responses of individual factors to external stressors, such as the social context, which may be common to other archaeological artifacts as well. Our study provides a new perspective on the evolution of Ryukyuan Kawara and presents a different discussion of and methods for the chronological study of material culture.

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• Mesozoic origin and 'out-of-India' radiation of ricefishes (Adrianichthyidae)

  Yamahira Kazunori, Ansai Satoshi, Kakioka Ryo, Yaguchi Hajime, Kon Takeshi, Montenegro Javier, Kobayashi Hirozumi, Fujimoto Shingo, Kimura Ryosuke, Takehana Yusuke, Setiamarga Davin H. E., Takami Yasuoki, Tanaka Rieko, Maeda Ken, Tran Hau D., Koizumi Noriyuki, Morioka Shinsuke, Bounsong Vongvichith, Watanabe Katsutoshi, Musikasinthorn Prachya, Tun Sein, Yun L. K. C., Masengi Kawilarang W. A., Anoop V. K., Raghavan Rajeev, Kitano Jun

  BIOLOGY LETTERS ( Biology Letters )  17 ( 8 ) 20210212 - 20210212   2021年08月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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  The Indian subcontinent has an origin geologically different from Eurasia, but many terrestrial animal and plant species on it have congeneric or sister species in other parts of Asia, especially in the Southeast. This faunal and floral similarity between India and Southeast Asia is explained by either of the two biogeographic scenarios, ‘into-India’ or ‘out-of-India’. Phylogenies based on complete mitochondrial genomes and five nuclear genes were undertaken for ricefishes (Adrianichthyidae) to examine which of these two biogeographic scenarios fits better. We found that <italic>Oryzias setnai</italic> , the only adrianichthyid distributed in and endemic to the Western Ghats, a mountain range running parallel to the western coast of the Indian subcontinent, is sister to all other adrianichthyids from eastern India and Southeast–East Asia. Divergence time estimates and ancestral area reconstructions reveal that this western Indian species diverged in the late Mesozoic during the northward drift of the Indian subcontinent. These findings indicate that adrianichthyids dispersed eastward ‘out-of-India’ after the collision of the Indian subcontinent with Eurasia, and subsequently diversified in Southeast–East Asia. A review of geographic distributions of ‘out-of-India’ taxa reveals that they may have largely fuelled or modified the biodiversity of Eurasia.

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• First record of the schindler’s fish, Schindleria praematura (actinopterygii: perciformes: schindleriidae), from the red sea

  Mohamed A. Abu El-Regal and Takeshi Kon

  Acta Ichthyologica et Piscatoria   49 ( 1 ) 75 - 78   2019年03月

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

• 琉球大学研究企画室の活動～学内外セクターとの連携強化を中心に

  西田 睦, 昆 健志, 高橋 そよ, 羽賀 史浩, 殿岡 裕樹

  産学連携学 ( 特定非営利活動法人 産学連携学会 )  15 ( 1 ) 1_30 - 1_40   2019年

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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  <p>昨今, 世界と日本社会は大きくかつ急速に変化しつつあり，大学が社会で大きな役割を果たすことへの期待がますます大きくなっている．琉球大学は創立時から「地域の発展に貢献する」ことをミッションとしてきたが，期待に応えるためにさらに様々な取組を強化する必要がある．そのための一環として，本学にリサーチアドミニストレーター（URA）が導入された．このURAが所属する研究企画室は，案件によって様々な部署と柔軟に連携を取ることによって，少人数でも効果的な活動を実現してきた．本稿では，4年近くにわたって進めてきた研究企画室の活動を，学内外セクターとの連携強化の試みに焦点を当てて紹介する．</p>

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• 分子系統樹を用いた分岐年代推定と生物多様化プロセス解析の概要

  昆 健志, 井上 潤

  化石 ( 日本古生物学会 )  106 ( 0 ) 5 - 17   2019年

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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  Understanding the process by which life diversifies is one of the central issues in biology. To clarify this process in focal taxa as well as to conduct phylogenetic analyses, a divergence time estimation —an important analysis to determine the timescale of a phylogenetic tree— must be performed. It is thought that the diversification process can be vividly reconstructed by estimating the diversification rate and ancestral geographic area, characterizing ancestral ecology, and mapping ancestral habitats according to a time-calibrated phylogenetic framework. Here we introduce a divergence time estimation method and various other methods for reconstructing the process of diversification based on the time-calibrated phylogenetic framework with some study examples of aquatic organisms, mainly fish.

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MISC（その他業績・査読無し論文等） 【 表示 ／ 非表示 】

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• ハゼ亜目魚類における地球規模的な分布域拡大過程の再構築

  昆健志, 佐土哲也, RUEBER Lukas, 佐藤崇, 佐藤行人, 吉野哲夫, 西田睦, 宮正樹

  日本魚類学会年会講演要旨   52nd   2019年

   

  J-GLOBAL

• 川と海を回遊するイーブーの起源:ハゼ亜目魚類における両側回遊の進化プロセス

  昆健志, 西田睦, 佐土哲也, 宮正樹

  沖縄生物学会誌   ( 53 ) 121   2015年03月

   

  J-GLOBAL

• ハゼ亜目における両側回遊の進化と多様化プロセス

  昆健志

  日本魚類学会年会講演要旨   47th   96   2014年11月

   

  J-GLOBAL

• ハゼ亜目魚類多様化プロセスの概要

  昆健志, 佐土哲也, RUBER Lukas, 佐藤崇, 吉野哲夫, 西田睦, 宮正樹

  日本魚類学会年会講演要旨   47th   45   2014年11月

   

  J-GLOBAL

• 砂浜に潜むリュウキュウナミノコハゼのミトコンドリアDNAおよび核DNAに基づく分子系統解析

  昆健志, 坂上治郎, 鈴木寿之

  沖縄生物学会誌   ( 52 ) 98   2014年03月

   

  J-GLOBAL

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研究発表等の成果普及活動 【 表示 ／ 非表示 】

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• ハゼ亜目魚類の多様性 : 異時性の視点から

  昆 健志

  Otsuchi marine science  1999年03月  -  1999年03月   

• 魚類耳石による宮城島島尻層群新里累層(鮮新世)の古魚類相と古水深の推定生物学会第33回講演要旨

  昆 健志

  沖縄生物学会誌  1997年05月  -  1997年05月   

• 魚類耳石による宮城島島尻層群新里累層(鮮新世)の古魚類相と古水深の推定生物学会第33回講演要旨

  昆 健志

  沖縄生物学会誌  1997年05月  -  1997年05月   

  CiNii Research

学術関係受賞 【 表示 ／ 非表示 】

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• 論文賞

  2015年   日本動物学会  

  受賞者: 昆健志

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  http://www.zoology.or.jp/news/index.asp?patten_cd=12&page_no=1102

• 論文賞

  2011年   日本魚類学会  

  受賞者: 昆健志

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  http://www.fish-isj.jp/iin/award/2011_senkou.html

科研費獲得情報 【 表示 ／ 非表示 】

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• 爆発的種分化した隠蔽種：幼形進化的シラスウオ科魚類の多様化プロセスの解明

  基盤研究(C)

  課題番号: 23570109

  研究期間: 2011年  -  2014年 

  代表者: 昆 健志 

  直接経費: 4,300,000（円）  間接経費: 1,290,000（円）  金額合計: 5,590,000（円）

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  本課題は極端な幼形進化を示すシラスウオ類の多様化プロセスを明らかにするために，（1）インドー太平洋産標本を収集して分布域全域をカバー，（2）スーパーマトリックス解析による隠蔽種の探索と次世代シーケンサーを利用したミトゲノムによる系統樹構築，（3）核ゲノムを併用した交雑の検出，（4）分岐年代推定および分岐パターン解析と研究を進めていく計画である．研究期間の最終年度であった平成25年度は，（1）のインド洋でのサンプリングを終了して，（4）までを一挙に進める予定であったが，予定していた紅海でのサンプリングがエジプトの政情不安により延期となったため，最終的な解析も延期した．しかしながら，その間のシラスウオ類を含むハゼ亜目全体の系統解析をミトゲノム全長配列+核遺伝子の部分塩基配列を用いて行い，ハゼ亜目魚類の主要な系統を網羅する120種による信頼度の高い頑健な系統樹を構築することに成功した．また，スーパーマトリックス法によって，DNAデータベースに登録された膨大な塩基配列データをこの系統樹に統合することにより，ハゼ亜目の全約2100種の3分の1に達する750種の巨大な系統樹も構築することが出来た．これらを基に分岐年代推定と分岐パターン解析を行った結果，シラスウオ類の系統的位置と起源が明らかになり，これらを含むハゼ亜目全体の進化プロセスの大枠も明らかになった．これらの成果は日本魚類学会の年会にて発表した．

• 爆発的種分化した隠蔽種：幼形進化的シラスウオ科魚類の多様化プロセスの解明

  基盤研究(C)

  課題番号: 23570109

  研究期間: 2011年  -  2013年 

  代表者: 昆 健志 

  直接経費: 4,300,000（円）  間接経費: 5,590,000（円）  金額合計: 1,290,000（円）

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  本課題は極端な幼形進化を示すシラスウオ類の多様化プロセスを明らかにするために，（1）インドー太平洋産標本を収集して分布域全域をカバー，（2）スーパーマトリックス解析による隠蔽種の探索と次世代シーケンサーを利用したミトゲノムによる系統樹構築，（3）核ゲノムを併用した交雑の検出，（4）分岐年代推定および分岐パターン解析と研究を進めていく計画である．研究期間の最終年度であった平成25年度は，（1）のインド洋でのサンプリングを終了して，（4）までを一挙に進める予定であったが，予定していた紅海でのサンプリングがエジプトの政情不安により延期となったため，最終的な解析も延期した．しかしながら，その間のシラスウオ類を含むハゼ亜目全体の系統解析をミトゲノム全長配列+核遺伝子の部分塩基配列を用いて行い，ハゼ亜目魚類の主要な系統を網羅する120種による信頼度の高い頑健な系統樹を構築することに成功した．また，スーパーマトリックス法によって，DNAデータベースに登録された膨大な塩基配列データをこの系統樹に統合することにより，ハゼ亜目の全約2100種の3分の1に達する750種の巨大な系統樹も構築することが出来た．これらを基に分岐年代推定と分岐パターン解析を行った結果，シラスウオ類の系統的位置と起源が明らかになり，これらを含むハゼ亜目全体の進化プロセスの大枠も明らかになった．これらの成果は日本魚類学会の年会にて発表した．

• 爆発的種分化した隠蔽種：幼形進化的シラスウオ科魚類の多様化プロセスの解明

  基盤研究(C)

  課題番号: 23570109

  研究期間: 2011年  -  2013年 

  代表者: 昆 健志 

  直接経費: 4,300,000（円）  間接経費: 5,590,000（円）  金額合計: 1,290,000（円）

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  本課題は極端な幼形進化を示すシラスウオ類の多様化プロセスを明らかにするために，（1）インドー太平洋産標本を収集して分布域全域をカバー，（2）スーパーマトリックス解析による隠蔽種の探索と次世代シーケンサーを利用したミトゲノムによる系統樹構築，（3）核ゲノムを併用した交雑の検出，（4）分岐年代推定および分岐パターン解析と研究を進めていく計画である．研究期間の最終年度であった平成25年度は，（1）のインド洋でのサンプリングを終了して，（4）までを一挙に進める予定であったが，予定していた紅海でのサンプリングがエジプトの政情不安により延期となったため，最終的な解析も延期した．しかしながら，その間のシラスウオ類を含むハゼ亜目全体の系統解析をミトゲノム全長配列+核遺伝子の部分塩基配列を用いて行い，ハゼ亜目魚類の主要な系統を網羅する120種による信頼度の高い頑健な系統樹を構築することに成功した．また，スーパーマトリックス法によって，DNAデータベースに登録された膨大な塩基配列データをこの系統樹に統合することにより，ハゼ亜目の全約2100種の3分の1に達する750種の巨大な系統樹も構築することが出来た．これらを基に分岐年代推定と分岐パターン解析を行った結果，シラスウオ類の系統的位置と起源が明らかになり，これらを含むハゼ亜目全体の進化プロセスの大枠も明らかになった．これらの成果は日本魚類学会の年会にて発表した．

• 爆発的種分化した隠蔽種：幼形進化的シラスウオ科魚類の多様化プロセスの解明

  基盤研究(C)

  課題番号: 23570109

  研究期間: 2011年  -  2013年 

  代表者: 昆 健志 

  直接経費: 4,300,000（円）  間接経費: 5,590,000（円）  金額合計: 1,290,000（円）

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  本課題は極端な幼形進化を示すシラスウオ類の多様化プロセスを明らかにするために，（1）インドー太平洋産標本を収集して分布域全域をカバー，（2）スーパーマトリックス解析による隠蔽種の探索と次世代シーケンサーを利用したミトゲノムによる系統樹構築，（3）核ゲノムを併用した交雑の検出，（4）分岐年代推定および分岐パターン解析と研究を進めていく計画である．研究期間の最終年度であった平成25年度は，（1）のインド洋でのサンプリングを終了して，（4）までを一挙に進める予定であったが，予定していた紅海でのサンプリングがエジプトの政情不安により延期となったため，最終的な解析も延期した．しかしながら，その間のシラスウオ類を含むハゼ亜目全体の系統解析をミトゲノム全長配列+核遺伝子の部分塩基配列を用いて行い，ハゼ亜目魚類の主要な系統を網羅する120種による信頼度の高い頑健な系統樹を構築することに成功した．また，スーパーマトリックス法によって，DNAデータベースに登録された膨大な塩基配列データをこの系統樹に統合することにより，ハゼ亜目の全約2100種の3分の1に達する750種の巨大な系統樹も構築することが出来た．これらを基に分岐年代推定と分岐パターン解析を行った結果，シラスウオ類の系統的位置と起源が明らかになり，これらを含むハゼ亜目全体の進化プロセスの大枠も明らかになった．これらの成果は日本魚類学会の年会にて発表した．

• 幼形進化に隠された多様性:サンゴ礁性シラスウオ科魚類の進化パターン分析

  基盤研究(C)

  課題番号: 20570084

  研究期間: 2008年  -  2010年 

  代表者: 昆 健志 

  直接経費: 3,700,000（円）  間接経費: 1,110,000（円）  金額合計: 4,810,000（円）

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  本課題において,ハワイ,パラオ,インドネシア,タイ,および沖縄にて採集を実施し,合計1500個体以上のシラスウオ科魚類を得た.パラオ産の分子系統解析では,5種の分布が確認され,そのうちの4種が新たに見つかった隠蔽種であったことから,本分類群は地域固有性が高い傾向にあると考えられた.また,ミトコンドリアDNA全長塩基配列を用いて系統解析を行った結果,シラスウオ科はクロユリハゼ科やオオメワラスボ科と一つのグループを形成し,タンザクハゼ属に近縁であることが明らかになった.

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