松波 雅俊 (マツナミ マサトシ)

Matsunami Masatoshi

写真a

職名

助教

科研費研究者番号

60632635

ホームページ

https://sites.google.com/site/masatoshimatsunami/

現在の所属組織 【 表示 / 非表示

  • 専任   琉球大学   医学研究科   助教  

取得学位 【 表示 / 非表示

  • 総合研究大学院大学 -  博士(理学)  博士(理学)

職歴 【 表示 / 非表示

  • 2012年04月
    -
    2015年03月

      北海道大学  

  • 2015年04月
    -
    2016年08月

      北海道大学  

  • 2016年09月
    -
    2018年12月

      琉球大学  

  • 2016年11月
    -
    2020年03月

      国立研究開発法人国立環境研究所  

  • 2019年01月
    -
    2023年03月

      特定国立研究開発法人理化学研究所  

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所属学会・委員会 【 表示 / 非表示

  •  
     
     
     

    日本進化学会

  •  
     
     
     

    日本生態学会

  •  
     
     
     

    日本動物学会

  •  
     
     
     

    日本人類学会

  •  
     
     
     

    Society for Molecular Biology and Evolution

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研究キーワード 【 表示 / 非表示

  • 集団遺伝

  • 表現型可塑性

  • 生命情報科学

  • 分子進化

  • 分子人類学

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研究分野 【 表示 / 非表示

  • ライフサイエンス / 生態学、環境学

  • ライフサイエンス / 進化生物学

  • ライフサイエンス / 自然人類学

論文 【 表示 / 非表示

  • Urodele amphibian newt bridges the missing link in evo-devo of the pancreas

    Morozumi, R; Okamoto, K; Enomoto, E; Tsukamoto, Y; Kyakuno, M; Suzuki, N; Tazawa, I; Furuno, N; Ogino, H; Kamei, Y; Matsunami, M; Shigenobu, S; Suzuki, K; Uemasu, H; Namba, N; Hayashi, T

    DEVELOPMENTAL DYNAMICS ( Developmental Dynamics )  254 ( 7 ) 812 - 828   2025年07月 [ 査読有り ]

    掲載種別: 研究論文(学術雑誌)

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    BACKGROUND: The pancreas exhibits diverse structures and roles across vertebrates. The pancreas has evolved to include both endocrine and exocrine cells, a change that occurred during the transition from fish to amphibian. This event emphasizes the evolutionary significance of amphibians. However, research has focused predominantly on anuran amphibians, with urodeles, such as newts, remaining underexplored. In this study, we investigated the development of the pancreas using Pleurodeles waltl as a model species of urodele. RESULTS: The newt pancreas consists of a single organ with exocrine tissue characterized by acinar structures and endocrine tissue forming islets. Notably, the newt possesses unique pancreas-like tissues on their intestines. We found that disruption of the newt Pancreatic and Duodenal Homeobox (Pdx) 1 gene resulted in an underdeveloped pancreas. Conversely, disruption of the Pdx2 paralog in newt had no significant impact on pancreatic development. CONCLUSION: The newt pancreas shows a morphology similar to that of the mammalian pancreas, which includes both exocrine and endocrine tissues. These results highlight the intermediate evolutionary position of the newt in the context of the evolution of pancreatic development. Our findings indicate that characterization of the newt pancreas will be crucial for understanding the evolutionary progression of pancreatic function in vertebrates.

  • Novel function of <i>Hox13</i> in regulating outgrowth of the newt hindlimb bud through interaction with <i>Fgf10</i> and <i>Tbx4</i>

    Tozawa, S; Matsubara, H; Minamitani, F; Kamei, Y; Saida, M; Asao, M; Suzuki, KIT; Matsunami, M; Shigenobu, S; Hayashi, T; Abe, G; Takeuchi, T

    DEVELOPMENT GROWTH & DIFFERENTIATION ( Development Growth and Differentiation )  67 ( 1 ) 10 - 22   2025年01月 [ 査読有り ]

    掲載種別: 研究論文(学術雑誌)

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    5'Hox genes regulate pattern formation along the axes of the limb. Previously, we showed that Hoxa13/Hoxd13 double-mutant newts lacked all digits of the forelimbs during development and regeneration, showing that newt Hox13 is necessary for digit formation in development and regeneration. In addition, we found another unique phenotype. Some of the Hox13 crispant newts showed hindlimb defects, in which whole or almost whole hindlimbs were lost, suggesting a novel function of Hox13 in limb development. Using germline mutants, we showed that mutation in Hox13 led to hindlimb defects. The limb buds of Hox13 crispants formed, however, did not show outgrowth. Expression of Fgf10 and Tbx4, which are involved in limb outgrowth, decreased in the hindlimb buds of Hox13 crispants. In addition, hindlimb defects were observed in both Fgf10 and Tbx4 crispant newts. Finally, Fgf10 and Tbx4 interacted with Hox13 genetically. Our results revealed a novel function of Hox13 in regulating the outgrowth of the newt hindlimb bud through interaction with Fgf10 and Tbx4.

  • Genome-wide association studies for pelvic organ prolapse in the Japanese population

    Matsunami, M; Imamura, M; Ashikari, A; Liu, XX; Tomizuka, K; Hikino, K; Miwa, K; Kadekawa, K; Suda, T; Matsuda, K; Miyazato, M; Terao, C; Maeda, S

    COMMUNICATIONS BIOLOGY ( Nature Research )  7 ( 1 ) 1188 - 9   2024年09月

    掲載種別: 研究論文(学術雑誌)

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    Pelvic organ prolapse (POP) affects approximately 40% of elderly women, characterized by thedescent of the pelvic organs into the vaginal cavity. Here we present the results of a genome-wideassociation study (GWAS) for susceptibility to POP comprising 771 cases and 76,625 controls in theJapanese population. We identified a significant association of WT1 locus with POP in the Japanesepopulation; rs10742277; odds ratio (OR) = 1.48, 95% confidence interval (CI), 1.29–1.68,P = 6.72 × 10−9. Subsequent cross-ancestry GWAS meta-analysis combining the Japanese data andpreviously reported European data, including 28,857 cases and 622,916 controls, identified FGFR2locus as a novel susceptibility locus to POP (rs7072877; OR = 1.06, 95% CI, 1.04–1.08,P = 4.11 × 10−8). We also observed consistent directions of the effects for 21 out of 24 European GWASderived loci (binomial test P = 2.8 × 10−4), indicating that most of susceptibility loci for POP are sharedacross the Japanese and European populations.

  • Demographic history of Ryukyu islanders at the southern part of the Japanese Archipelago inferred from whole-genome resequencing data

    Koganebuchi, K; Matsunami, M; Imamura, M; Kawai, Y; Hitomi, Y; Tokunaga, K; Maeda, S; Ishida, H; Kimura, R

    JOURNAL OF HUMAN GENETICS ( Journal of Human Genetics )  68 ( 11 ) 759 - 767   2023年11月 [ 査読有り ]

    掲載種別: 研究論文(学術雑誌)

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    The Ryukyu Islands are located in the southernmost part of the Japanese Archipelago and consist of several island groups. Each island group has its own history and culture, which differ from those of mainland Japan. People of the Ryukyu Islands are genetically subdivided; however, their detailed demographic history remains unclear. We report the results of a whole-genome sequencing analysis of a total of 50 Ryukyu islanders, focusing on genetic differentiation between Miyako and Okinawa islanders. We confirmed that Miyako and Okinawa islanders cluster differently in principal component analysis and ADMIXTURE analysis and that there is a population structure among Miyako islanders. The present study supports the hypothesis that population differentiation is primarily caused by genetic drift rather than by differences in the rate of migration from surrounding regions, such as the Japanese main islands or Taiwan. In addition, the genetic cline observed among Miyako and Okinawa islanders can be explained by recurrent migration beyond the bounds of these islands. Our analysis also suggested that the presence of multiple subpopulations during the Neolithic Ryukyu Jomon period is not crucial to explain the modern Ryukyu populations. However, the assumption of multiple subpopulations during the time of admixture with mainland Japanese is necessary to explain the modern Ryukyu populations. Our findings add insights that could help clarify the complex history of populations in the Ryukyu Islands.

  • Natural Selection Signatures in the Hondo and Ryukyu Japanese Subpopulations

    Liu, XX; Matsunami, M; Horikoshi, M; Ito, S; Ishikawa, Y; Suzuki, K; Momozawa, Y; Niida, S; Kimura, R; Ozaki, K; Maeda, S; Imamura, M; Terao, C

    MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION ( Molecular Biology and Evolution )  40 ( 10 )   2023年10月 [ 査読有り ]

    掲載種別: 研究論文(学術雑誌)

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    Natural selection signatures across Japanese subpopulations are under-explored. Here we conducted genome-wide selection scans with 622,926 single nucleotide polymorphisms for 20,366 Japanese individuals, who were recruited from the main-islands of Japanese Archipelago (Hondo) and the Ryukyu Archipelago (Ryukyu), representing two major Japanese subpopulations. The integrated haplotype score (iHS) analysis identified several signals in one or both subpopulations. We found a novel candidate locus at IKZF2, especially in Ryukyu. Significant signals were observed in the major histocompatibility complex region in both subpopulations. The lead variants differed and demonstrated substantial allele frequency differences between Hondo and Ryukyu. The lead variant in Hondo tags HLA-A*33:03-C*14:03-B*44:03-DRB1*13:02-DQB1*06:04-DPB1*04:01, a haplotype specific to Japanese and Korean. While in Ryukyu, the lead variant tags DRB1*15:01-DQB1*06:02, which had been recognized as a genetic risk factor for narcolepsy. In contrast, it is reported to confer protective effects against type 1 diabetes and human T lymphotropic virus type 1-associated myelopathy/tropical spastic paraparesis. The FastSMC analysis identified 8 loci potentially affected by selection within the past 20-150 generations, including 2 novel candidate loci. The analysis also showed differences in selection patterns of ALDH2 between Hondo and Ryukyu, a gene recognized to be specifically targeted by selection in East Asian. In summary, our study provided insights into the selection signatures within the Japanese and nominated potential sources of selection pressure.

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著書 【 表示 / 非表示

  • ゲノム多様性解析

    長田, 直樹, 藤本, 明洋, 河合, 洋介, 五條堀, 淳, 東野, 俊英, 木村, 亮介, 理学, 松波, 雅俊 ( 担当: 分担執筆 )

    森北出版  2025年03月 ( ページ数: vii, 242p )

  • ヤポネシアの現代人ゲノム

    斎藤, 成也 ( 担当: 分担執筆 , 担当範囲: 宮古諸島人のゲノム解析 )

    朝倉書店  2025年03月 ( ページ数: xi, 173p, 図版4p(ページ付なし) )

  • ゲノム多様性解析 = Genome diversity analysis

    長田 直樹 , 藤本 明洋, 河合 洋介, 五條堀 淳, 東野 俊英, 木村 亮介 理学, 松波 雅俊 ( 担当: 単著 )

    森北出版  2025年

  • ヒトゲノム事典

    井ノ上, 逸朗, 今西, 規, 河村, 正二, 斎藤, 成也, 颯田, 葉子, 田嶋, 敦 ( 担当: 分担執筆 )

    一色出版  2021年11月 ( ページ数: 431p )

  • 最新DNA研究が解き明かす。日本人の誕生

    斎藤成也, 木村亮介, 鈴木留美子, 河合洋介, 松波雅俊 ( 担当: 分担執筆 )

    秀和システム  2020年08月 ( ページ数: 239p )

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MISC(その他業績・査読無し論文等) 【 表示 / 非表示

  • 琉球列島における全ゲノム配列データを用いたヒト集団史の推定

    小金渕 佳江, 松波 雅俊, 今村 美菜子, 河合 洋介, 徳永 勝士, 前田 士郎, 石田 肇, 木村 亮介

    Anthropological Science(Japanese Series) ( (一社)日本人類学会 )  128 ( 1 ) 52 - 53   2020年06月

     

  • 琉球列島人の集団ゲノム解析

    松波雅俊, 今村美菜子, 小金渕佳江, 木村亮介, 堀越桃子, 寺尾知可史, 鎌谷洋一郎, 石田肇, 前田士郎

    日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web)   21st   105 (WEB ONLY)   2019年08月

     

    J-GLOBAL

  • 遺伝子発現量の表現型値への影響度を推定する統計学的手法の開発

    道前洋史, 松波雅俊, 江村剛志

    日本生態学会大会講演要旨(Web)   66th   ROMBUNNO.P2‐367 (WEB ONLY)   2019年02月

     

    J-GLOBAL

  • ゲノムワイド関連解析による緑内障の疾患感受性ゲノム領域の探索

    木下 陽樹, 松波 雅俊, 今村 美菜子, 前田 士郎

    琉球医学会誌 ( 琉球医学会 )  38 ( 1-4 ) 106 - 106   2019年

     

  • ゲノムワイド関連解析による日本人の心筋梗塞疾患関連遺伝子座の同定

    長嶺 匠悟, 松波 雅俊, 今村 美菜子, 前田 士郎

    琉球医学会誌 ( 琉球医学会 )  38 ( 1-4 ) 113 - 113   2019年

     

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学術関係受賞 【 表示 / 非表示

  • 特推琉球医学会賞

    2025年03月   琉球医学会   Genome-wide association studies for pelvic organ;prolapse in the Japanese population  

    受賞者: 松波 雅俊

  • 第九回優秀論文賞

    2022年04月   琉球医学会   Fine-scale genetic structure and demographic history in the Miyako Islands of the Ryukyu Archipelago.  

    受賞者: 松波 雅俊

  • 日本遺伝学会誌「Genes & Genetic Systems (GGS)」優秀論文賞2021 (GGS PRIZE 2021)

    2021年09月   日本遺伝学会  

    受賞者: Mori S, Matsunami M

  • 令和元年度 琉球大学 大学院医学研究科 研究・教育業績評価優秀者

    2021年02月   ■■■  

    受賞者: ■■■

  • 平成30年度 琉球大学 大学院医学研究科 研究・教育業績評価優秀者

    2020年02月   ■■■  

    受賞者: ■■■

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科研費獲得情報 【 表示 / 非表示

  • 遺伝系統樹と言語系統樹の矛盾を検討する

    挑戦的研究(萌芽)

    課題番号: 23K17503

    研究期間: 2023年06月  -  2026年03月 

    代表者: 松波 雅俊, 麻生 玲子, CELIK KENAN 

    直接経費: 5,000,000(円)  間接経費: 6,500,000(円)  金額合計: 1,500,000(円)

  • 琉球列島における先史人類および文化の形成

    学術変革領域研究(A)

    課題番号: 23H04842

    研究期間: 2023年04月  -  2028年03月 

    代表者: 木村 亮介, 山崎 真治, 松波 雅俊, 竹中 正巳 

    直接経費: 72,600,000(円)  間接経費: 94,380,000(円)  金額合計: 21,780,000(円)

  • 古代ゲノム解析による島嶼地域への定住プロセスの解明

    基盤研究(B)

    課題番号: 23K27257

    研究期間: 2023年04月  -  2027年03月 

    代表者: 松波 雅俊, 今村 美菜子, 前田 士郎, 瀧上 舞, 安達 登, 片桐 千亜紀, 角田 恒雄, 神澤 秀明 

    直接経費: 14,400,000(円)  間接経費: 18,720,000(円)  金額合計: 4,320,000(円)

  • 生活習慣病リスクと関連する疾患感受性ミトコンドリアゲノム多型の網羅的探索

    基盤研究(C)

    課題番号: 23K07992

    研究期間: 2023年04月  -  2026年03月 

    代表者: 今村 美菜子, 前田 士郎, 松波 雅俊 

    直接経費: 3,300,000(円)  間接経費: 4,290,000(円)  金額合計: 990,000(円)

  • 複数の小規模・大規模交雑がもたらすイモリの網状進化とモザイク的な集団構造の検証

    基盤研究(C)

    課題番号: 21K06321

    研究期間: 2021年04月  -  2024年03月 

    代表者: 富永 篤, 松波 雅俊 

    直接経費: 3,300,000(円)  間接経費: 4,290,000(円)  金額合計: 990,000(円)

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