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論文 【 表示 ／ 非表示 】

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• Amoxetamide A, a new anoikis inducer, produced by combined-culture of Amycolatopsis sp. and Tsukamurella pulmonis

  Pan, CQ; Ikeda, H; Minote, M; Tokuda, T; Kuranaga, T; Taniguchi, T; Shinzato, N; Onaka, H; Kakeya, H

  JOURNAL OF ANTIBIOTICS ( Journal of Antibiotics )  77 ( 1 ) 66 - 70   2023年10月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（その他学術会議資料等）

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• 嫌気性繊毛虫に見られる微生物間共生

  新里尚也

  細胞   55 ( 6 ) 37 - 41   2023年05月

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

• Complete Genome Sequence of "<i>Candidatus</i> Hydrogeosomobacter endosymbioticus," an Intracellular Bacterial Symbiont of the Anaerobic Ciliate Scuticociliate GW7.

  Shiohama Y, Takeshita K, Hirakata Y, Nobu MK, Ito M, Shinzato N

  Microbiology resource announcements ( Microbiology Resource Announcements )  11 ( 2 ) e0115021   2022年02月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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  The bacterium “ <italic>Candidatus</italic> Hydrogenosomobacter endosymbioticus” is an intracellular symbiont of anaerobic scuticociliate GW7, which is associated with hydrogenosome together with methanogenic archaea. Here, we report a complete genome sequence of the symbiont consisting of 827 kbp. Knowing this sequence would contribute to the understanding of the metabolic interactions and evolution of the tripartite symbiosis.

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• Amycolapeptins A and B, Cyclic Nonadepsipeptides Produced by Combined-culture of <i>Amycolatopsis</i> sp. and <i>Tsukamurella pulmonis</i>.

  Pan C, Kuranaga T, Cao X, Suzuki T, Dohmae N, Shinzato N, Onaka H, Kakeya H

  The Journal of organic chemistry ( Journal of Organic Chemistry )  86 ( 2 ) 1843 - 1849   2021年01月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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  Two nonapeptide natural products, amycolapeptins A (1) and B (2) with a 22-membered cyclic depsipeptide skeleton, β-hydroxytyrosine, and a highly modified side chain, which were not produced in a monoculture of the rare actinomycete Amycolatopsis sp. 26-4, were discovered in broth of its combined-culture with Tsukamurella pulmonis TP-B0596. The planar structures were elucidated by spectroscopic analyses (extensive 2D-NMR and MALDI-TOF MS/MS). The absolute configurations of component amino acids were unambiguously determined by the highly sensitive advanced Marfey's method we recently developed. Additionally, the structures of unstable/unusual moieties were corroborated by chemical synthesis and CD analysis.

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• Pseudoalteropeptide A, A Novel Lipopeptide from the Marine Bacterium Pseudoalteromonas piscicida SWA4_PA4 Isolated from Marine Seaweed

  Reiko Ueoka, Naoya Shinzato, Noritaka Kagaya, Hikaru Suenaga, Kazuo Shin-ya

  The Journal of Antibiotics   74   105 - 110   2020年10月 [ 査読有り ]

  掲載種別: 研究論文（学術雑誌）

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著書 【 表示 ／ 非表示 】

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• 原生生物学事典

  矢崎 裕規, 新倉 保, 猪飼 桂, 矢吹 彬憲, 永宗 喜三郎, 松崎 素道, 白鳥 峻志, 島野 智之, 小林 富美惠 ( 担当: 編著 , 担当範囲: 3-45 活性汚泥中の原生生物 )

  朝倉書店  2023年05月 ( ページ数: 464 )

• 原生生物学事典

  矢崎 裕規, 新倉 保, 猪飼 桂, 矢吹 彬憲, 永宗 喜三郎, 松崎 素道, 白鳥 峻志, 島野 智之, 小林 富美恵 ( 担当: 分担執筆 , 担当範囲: 3-45 活性汚泥中の原生生物 )

  朝倉書店  2023年05月

• Microbiology Monographs 19, (Endo)symbiotic methangenic archaea 2nd edition

  Shinzato N, Takeshita K, Kamagata Y ( 担当: 分担執筆 , 担当範囲: Methanogenic and bacterial endosymbionts of anaerobic free-living ciliates )

  Springer-Verlag, Berlin Heidelberg  2018年11月 ( 担当ページ: p.37-53 )

• バイオサイエンスとインダストリー. 62

  新里尚也 ( 担当: 単著 )

  その他の出版機関  2004年03月 ( 担当ページ: p.4 )

• 今中忠行監修『微生物利用の大展開』

  新里尚也, 渡辺吉雄 ( 担当: 共著 )

  エヌ・ティー・エス出版  2001年03月 ( 担当ページ: p.8 )

MISC（その他業績・査読無し論文等） 【 表示 ／ 非表示 】

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• Functional genomics of the Lactobacillus paracasei strain LC-Ikematsu isolated from the Okinawan natural environment

  Tada I, Saitoh S, Aoyama H, Shinzato N, Morita K, Yamamoto N, Ikematsu S

  沖縄工業高等専門学校紀要   11   1 - 8   2017年03月

   

• ヒョウタンナガカメムシ類で見つかった環境獲得型細胞内共生

  竹下和貴, 松浦優, 孟憲英, 三谷恭雄, 新里尚也, 菊池義智, 菊池義智

  日本応用動物昆虫学会大会講演要旨   61st   92   2017年03月

   

  J-GLOBAL

• カメムシ類における垂直伝播を伴わない細胞内共生

  菊池義智, 竹下和貴, 竹下和貴, 松浦優, 孟憲英, 新里尚也, 三谷恭雄

  日本微生物生態学会大会(Web)   2017   ROMBUNNO.O‐033 (WEB ONLY)   2017年

   

  J-GLOBAL

研究発表等の成果普及活動 【 表示 ／ 非表示 】

研究発表等の成果普及活動 【 表示 ／ 非表示 】

• 海綿における生理活性物質と共生バクテリアの相関解析

  田中志貴子, 白井由実, 伊藤通浩, 新里尚也

  日本共生生物学会  (神戸大学, 神戸)  2018年11月  -  2018年11月   

• 嫌気性繊毛虫におけるメタン菌、バクテリアとの共生関係

  竹下和貴, 山田尊貴, 川原邑斗, 成廣隆, 鎌形洋一, 新里尚也

  日本微生物生態学会  (沖縄コンベンションセンター, 宜野湾)  2018年07月  -  2018年07月   

• 沖縄微生物ライブラリーを利用した植物病原糸状菌の抑制

  上野誠, 田村朋子, Yokoyama Y, Ganphung R, 新里尚也, 伊藤通浩

  日本微生物生態学会  (沖縄コンベンションセンター, 宜野湾)  2018年07月  -  2018年07月   

• 沖縄産Axinella 属カイメン類の共生微生物相 - 地球の反対側との比較

  砂川春樹, Sanghwa Park, 青山洋昭, 長濱秀樹, 金本明彦, 齋藤星耕, 伊藤通浩, 新里尚也

  日本微生物生態学会  (沖縄コンベンションセンター, 宜野湾)  2018年07月  -  2018年07月   

科研費獲得情報 【 表示 ／ 非表示 】

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• 下水処理プロセスを担う原生動物のメタン生成マイクロリアクターとしての代謝基盤解析

  基盤研究(B)

  課題番号: 21H01467

  研究期間: 2021年04月  -  2026年03月 

  代表者: 新里 尚也 

  直接経費: 12,900,000（円）  間接経費: 16,770,000（円）  金額合計: 3,870,000（円）

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  本研究では、下水処理プロセスより分離培養に成功した数少ない原生動物株を用いて、その生物活性を支えていると考えられる共生微生物の役割について明らかにすることを目的としている。本研究では、昨年度までに宜野湾浄化センターより培養株を樹立した嫌気性繊毛虫である、Scuticocilliatia GW7株に見出された、α-プロテオバクテリアに属する細胞内共生体、ヒドロゲノソモバクター・エンドシンビオティカスの機能推定を目的として、共生体ゲノムのショットガンシーケンスを行ってドラフトゲノムを取得することに成功している。今年度は、リピート配列により環状化していなかった当該ゲノムの一部領域について、プライマー・ウォーキングを行い、827kbの完全長配列を得ることができた。当該ゲノムは多くの細胞内共生体で見られるようにGC含量が約40％とかなり低く、GW7株とかなり長期にわたって共生関係を築いてきた事が伺えた。また、アノテーションを行った結果、縮退したゲノムに721のタンパク質をコードしていることが示された。ヒドロゲノソモバクターのゲノム解析の結果については、昨年度、概要をまとめて論文として発表した（Shiohama, 2022）。 また、具志川浄化センターから培養化に成功した3株の嫌気性原生動物株について、18SリボソーマルRNA遺伝子による分子同定を行った結果、それらはいずれも下水処理プロセスから報告されている、メトプス・コントールタス、トリミエマ・フィンレイ、トリコミタス・spであることが明らかとなった。蛍光顕微鏡観察と超薄切片の電子顕微鏡観察の結果、メトプス・コントールタスとトリミエマ・フィンレイにはメタン生成菌が細胞内共生している様子が伺えた。

• 下水処理プロセスを担う原生動物のメタン生成マイクロリアクターとしての代謝基盤解析

  基盤研究(B)

  課題番号: 21H01467

  研究期間: 2021年04月  -  2025年03月 

• 下水処理プロセスを担う原生動物の代謝基盤の解析と微生物間代謝ネットワークの解明

  基盤研究(B)

  課題番号: 17H01901

  研究期間: 2017年04月  -  2022年03月 

  代表者: 新里 尚也 

  直接経費: 13,500,000（円）  間接経費: 17,550,000（円）  金額合計: 4,050,000（円）

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  本研究では、下水処理プロセスで水の浄化に主要な役割を果たす、トリミエマ原虫の共生バクテリアTC1の全ゲノム情報を解析し、TC1が宿主原虫よりアミノ酸を得て脂質の合成を活発に行っている可能性を示した。また、シクリディウム属に近縁な原生動物（シクリディウム原虫）にもメタン生成菌に加えて、機能未知の共生バクテリアが存在することを明らかにし、これをヒドロゲノソモバクター・エンドシンビオティカスと命名した。組織化学的解析の結果、メタン生成菌とヒドロゲノソモバクターは共に、宿主の水素生成オルガネラである、ヒドロゲノソームに密着して存在していることが示された。

• 下水処理プロセスを担う原生動物の代謝基盤の解析と微生物間代謝ネットワークの解明

  基盤研究(B)

  課題番号: 17H01901

  研究期間: 2017年04月  -  2021年03月 

  代表者: 新里　尚也 

  直接経費: 13,500,000（円）  間接経費: 4,050,000（円）  金額合計: 17,550,000（円）

• トリミエマ原虫共生系を用いた細胞内共生研究モデルの構築

  新学術領域研究(研究領域提案型)

  課題番号: 26117721

  研究期間: 2014年04月  -  2016年03月 

  代表者: 新里　尚也 

  直接経費: 4,400,000（円）  間接経費: 1,320,000（円）  金額合計: 5,720,000（円）

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その他研究費獲得情報 【 表示 ／ 非表示 】

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• 「先端バイオ研究基盤高度化事業」の分担課題　　「沖縄創薬資源微生物の遺伝子解析（紅麹菌発現関連）および沖縄環境微生物の遺伝子解析と利用」

  研究費種類: 財団・社団法人等の民間助成金  参画方法: その他

  研究種別: 受託研究  事業名: -

  研究期間: 2009年05月  -  2010年03月 

  代表者: 松井　徹  連携研究者: 新里　尚也  資金配分機関: 財団法人沖縄科学技術振興センター 理事長　諸喜田　茂充

  直接経費: 1,575,000（円）  間接経費: 315,000（円）  金額合計: 1,890,000（円）